第一章 微生物学绪论
一、微生物学研究的对象和任务。
二、微生物学发展简史和重要代表人物。
三、微生物学研究的意义。微生物在工业、农业、医学、食品卫生、环境保护和生命科学研究和技术发展中的重要应用。
第二章 微生物的分类
一、生物的分类单元
二、微生物的命名
三、微生物的分类依据和方法
四、进化的测量指征
进化指征的选择、RNA作为进化的指征、rRNA和系统发育树
第三章 微生物类群与形态结构
一、真细菌
1、细菌结构及功能、繁殖与群体形态、分类系统、工业上重要的细菌及其应用。
2、放线菌的形态与结构、生长与繁殖方式、生理特性、与细菌和霉菌的比较、工业上有重要用途的主要放线菌。
3、大型原核微生物 － 蓝细菌的形态特征及大小、细胞结构及组成、生理特性和主要用途。
二、古生菌
概念的提出、细胞形态、细胞结构
三、真核微生物
酵母菌和霉菌的形态与大小、细胞结构、培养特征、繁殖方式、分类位置、工业上有重要用途的主要酵母和霉菌。
形成大型肉质子实体的真菌—蕈菌的生长发育过程、繁殖方式和主要用途。
四、病毒
病毒的主要特征、噬菌体的形态结构、噬菌体的生长繁殖方式、噬菌体与工业微生物发酵生产。
第四章 微生物的生长繁殖及其控制
一、微生物的营养
微生物的营养物质及其功能、微生物的营养类型及代表微生物、吸收营养物质的方式、微生物培养基。
二、微生物生长
微生物生长的研究方法、微生物生长的测定方法、微生物生长方式和微生物的群体生长的规律；连续培养。
三、环境因素对微生物生长的影响 温度、pH、氧和辐射等对微生物生长繁殖的影响。
四、微生物生长的控制 物理控制（高温、低温、辐射、干燥和渗透压、过滤）；化学控制（消毒剂和防腐剂）；化学治疗剂的种类及其抗菌抑菌治疗疾病的原理；抗生素的发现和定义、种类、作用机制；微生物的抗药性。
第五章 微生物的代谢调控
一、微生物代谢的多样性：微生物生物氧化的类型和产能、工业微生物重要的分解代谢途径及产物
二、微生物初级代谢产物的代谢调节：诱导酶的产生与反馈阻遏、分解代谢产物阻遏、酶活性的反馈抑制、微生物代谢调节的特性、代谢调节的人工控制
三、微生物次级代谢产物的代谢调节：次级代谢产物的特征、次级代谢的主要调节机制
微生物产物发酵的代谢调控：氨基酸类物质发酵的代谢调控、核苷酸类物质发酵的代谢调控、β－内酰胺类抗生素发酵的代谢调控。
第六章 微生物遗传变异与育种
一、微生物菌种的筛选：微生物菌种获得的途径、工业微生物的筛选
二、微生物遗传学：遗传变异的物质基础、微生物的染色体分子结构、微生物基因组、染色体外遗传成份、转座遗传因子
三、基因突变：基因突变概述、特点、表型特性、突变机制、修复
四、基因重组：原核生物的基因重组、真核微生物的基因重组
五、微生物育种：诱变育种、代谢调节控制育种、杂交育种、原生质体融合育种；基因工程只作一般介绍
第七章 微生物生态
一、微生物在自然界中的分布 土壤、水体、空气、工农业产品、正常人体及动物体上以及极端环境中微生物的分布。
二、微生物的生物环境 互生、共生、拮抗和寄生的概念和典型实例。
三、微生物在自然界物质循环中的作用
四、微生物与环境保护 微生物与污水处理；微生物与环境监测。