以下是四川大学各学院2013年硕士研究生招生专业目录汇总：
| 经济学院 | 法学院 | 文学与新闻学院 | 高分子科学与工程学院 |
| 外国语学院 | 电子信息学院 | 物理科学与技术学院 | 基础医学与法医学院 |
| 数学学院 | 历史文化学院 | 材料科学与工程学院 | 教育部移植工程重点实验室 |
| 化学学院 | 生命科学学院 | 制造科学与工程学院 | 循证医学教育部网上合作中心 |
| 艺术学院 | 电气信息学院 | 建筑与环境学院 | 中美大学战略规划研究所 |
| 计算机学院 | 水利水电学院 | 轻纺与食品学院 | 视觉合成图形图像技术实验室 |
| 临床医学院 | 化学工程学院 | 生物治疗重点实验室 | 原子与分子物理研究所 |
| 口腔医学院 | 公共卫生学院 | 公共管理学院 | 生物材料工程研究中心 |
| 药学院 | 再生医学中心 | 工商管理学院 | 原子核科学技术研究所 |
| 南亚研究所 | 分析测试中心 | 马克思主义学院 | 制革清洁技术国家工程实验室 |
| 航空航天学院 | 体育科学研究所 | 道教与宗教文化研究所 | 纳米生物医学技术与膜生物学研究所 |