1．高水平学科（6个）：外科学（泌尿）、生理学、外科学（普外）、生药学、药理学、社会医学与卫生事业管理。
2．重点学科（6个）：病原生物学、影像医学与核医学、药物化学、生化与分子生物学、卫生毒理学、外科学（骨外）。
3．重点建设学科（6个）：思想政治理论、内科学（心血管）、人体解剖与组织胚胎学、计算机科学与技术、临床检验诊断学、营养与食品卫生学。
4．重点扶持学科（9个）：康复治疗学（康复学院）、护理学（护理学院）、外科学（二附院微创外科）（二附院）、康复临床（三附院）、心理学（心理学系）、英语语言文学（外语系）、眼科学（眼耳鼻喉系）、麻醉学（麻醉系）、病理学与病理生理学（法医学系）。