1988年成立了电子工程系，并于当年开始招收应用电子技术专业（专科）学生，1993年又新增了计算机应用（专科）专业。1995年将应用电子技术专科专业升为本科专业。1997年，随着教育部高等学校专业调整改革方案将应用电子技术和计算机应用专业合并更名为信息工程（本科）专业，同时停止了计算机应用专业（专科）招生。并于当年将电子工程系更名为电子与信息工程系。
随着学院招生规模逐渐扩大，电子与信息工程系原有的专业已不能满足社会和少数民族地区对专业人才的需求，2001年增设了通信工程、自动化、计算机科学与技术3个本科专业；2002年增设了测控技术与仪器本科专业；2005年增设了电气工程及其自动化本科专业。
电子与信息工程系为了进一步提升办学层次，于2003年、2005年分别申报了计算机应用和电路与系统两个专业的硕士点均获得国务院学位办批准，分别于2005、2007年开始招生。
为了适应学校的快速发展，1998年以电信系数学教研室为基础成立了信息与计算科学系；2002年由电信系物理教研室和信息与计算科学系的数学教研室为基础成立了基础部；2003年4月由电信系的计算机科学与技术专业和计算机教研室为基础，成立了计算机科学与技术系，同时将计算机应用硕士点划归为计算机系。
2006年10月，学校为了做好 “去筹”、“更名”的准备工作，将电子与信息工程系更名为电气信息工程学院，并将原创新中心撤销后的部分设备和教师合并到电气信息工程学院。