植物学硕士点是我国著名植物学家孔宪武教授的领导下建立起来的，是我国第一批批准设立的学位点之一，1993年以来一直是省级或校级重点学科，取得了许多重要成果，在国内外享有较高的声誉。近年来，在坚持传统优势和特色的基础上，以服务西部环境和经济建设为目标，选择青藏高原和西北干旱地区等具有区域特色的植物类群为研究对象，利用现代生命科学研究的多学科手段和方法，从不同水平开展植物学的基础和应用研究，形成了系统与进化植物学、植物细胞与分子遗传学、植物生理生态学、资源植物学等4个主要研究方向。近年来，在国内外重要学术刊物上发表论文200余篇，其中SCI刊物论文14篇，出版专著或教材5部，获甘肃省教学或科研成果等奖励多项，承担国家自然科学基金项目4项，其它各类项目40余项，争取科研经费200多万元。
目前，植物学硕士点在系统与进化植物学、植物细胞与分子遗传学、植物生理生态、资源植物学4个主要研究方向招收硕士研究生，开设了植物进化生物学、分子生物学、植物分类学专题、生态学思想发展史、植物科学进展专题、结构植物学、分子遗传学导轮、植物化学、生态学原理与方法、分子生态学、植物区系地理等课程。目前在读硕士研究生34人。
研究生导师：
系统与进化植物学方向：廉永善 孙坤 陈学林
植物生理生态方向：马瑞君 赵庆芳 宋占午
植物分子遗传学方向：于玲
植物资源开发利用方向：张继 王一峰 丁兰