公共课程部，是云南中医学院二级教学管理部门，下设外语、大学语文、体育三个教研室。承担学院本专、科、研究生英语。日校本、专科体育、大学语文以及泰国等留学生的对外汉语、传统保健体育等教学任务。在学院党、政的领导下，公共课程部全体教职员工围绕学院“十一五”发展规划，坚持以本科教学为主，积极开拓、与时俱进、爱岗敬业、始终保持高昂的工作热情，聚精会神抓教学，一心一意谋发展，全身心地投入学院的建设与发展。
公共课程部现有教职工25人，其中专职教师21人、硕士研究生4人、研究生学历1人、在职读研7人、学士学位9人，副教授8人、讲师4人．公共课程部三个教研室分别开设了《武术》、《足球》、《排球》、《艺术体操》、《篮球》、《散打》、《世界流行音乐艺术欣赏》、《中医英语》、《英语提高》、《英语语法训练》、《英语四级考试辅导》等选修课。
公共课程部注重教师队伍建设，牢固树立科学发展观，部门班子团结、求真、务实，带领全体教师以教书育人为己任，认真做好教学、科研工作，教学质量稳步提高。
自2003年以来教师参编全国中医药院校体育教材《体育与健康教程》1部、全省统编《大学语文》教材1部，全省统编英语辅导教材5部。担任主编1人，副主编6人。教师自编全院性选修课教材1部。自2003年以来，我部教师申报省教育厅科研基金项目4项。教师发表论文30余篇，译著4部。部门汇编出版教师论文集一部。《传统保健体育》于2005年纳入学院重点课程建设。