学院社会科学部（简称社科部）是1986年8月在原马克思主义教研室基础上成立的，下设马克思主义哲学原理、马克思主义政治经济学原理、毛泽东思想概论、邓小平理论概论、思想品德教育、医学伦理学、大学语文等七个教研室，此外，还设有部办公室及资料室。
社科部现有教师22人，其中副教授12人、讲师7人、助教3人，担负着全院本、专科和研究生、夜大学生及成人全脱产学生马克思主义理论和思想品德教育的教学任务，是学院思想政治教育的主要渠道和阵地。共有16人参编或担任主编、副主编已出版的云南省教育厅统编教材8本，主编、参编多种专著27本，在省内外各种刊物上发表论文300余篇。
社科部为本、专科生开设了马克思主义哲学原理、马克思主义政治经济学原理、毛泽东思想概论、邓小平理论概论、思想道德修养、法律基础、卫生法学、形势与政策、医学伦理学、大学语文等必修课程和医学美学、卫生经济学、生命伦理与法、临床思维方法导论、中西文化比较等选修课程。为硕士研究生开设自然辩证法、科学社会主义理论与实践两门课程。为博士生开设当代科技革命与马克思主义课程。其中医学伦理学、思想品德教育、马克思主义哲学原理、毛泽东思想概论、邓小平理论概论被列为学院一类重点课程。