基础与信息工程学院前身为1961年成立的昆明农林学院基础部，2001年正式成立基础与信息工程学院，学院目前主要承担全校数、理、化、计算机类公共基础课程以及本学院五个本科专业的教学工作和科研工作。现设置计算机科学与技术、电子信息工程、应用数学和应用化学四个系，共有计算机科学与技术、网络工程、电子信息工程、应用数学、应用化学五个本科专业和农业信息化方向农业推广硕士。学院建有云南省高校“农业信息技术”重点实验室、校级“基础实验教学中心”和三个院级专业实验室。设有云南省“全国计算机等级考试考点”、“全国计算机软件水平考试报名点”。全院拥有一支教学经验丰富、结构合理、团结协作的师资队伍，在编教职工82人，副高以上教师22人，其中教授4人，硕士生导师4人。
教学工作是学院工作的中心。学院以改革教学内容和课程体系为核心，以建立教学质量评价机制为保障，以提高教学质量为落脚点，突出教学工作的中心地位。学院教师所主持的教学研究项目荣获2005年、2009年省级优秀教学成果二等奖各一项，所参与的教学研究项目获省级优秀教学成果一等奖一项。目前，在建两门省级精品课程和一门校级精品课程。先后有教师被评为全国优秀教师、全国先进实验室工作者，部分教师被聘为国家级、省级教学指导委员会委员，多名教师在省级、校级讲课比赛中获奖。
学科建设和科研工作是学院工作的重点。学院发挥多学科和现代信息技术优势，加强与外界的合作，主持了国家“十一五”科技支撑计划重大项目课题、国家863计算机软硬件示范区课题、省自然科学基金项目、省教育厅基金项目等三十余项研究课题，同时积极进行科技成果转化推广服务工作，与多家企业建立良好合作关系。近三年，全院教职工发表研究论文百余篇，其中20余篇被SCI、EI收录，编写教材30余部，获云南省科技进步三等奖一项、获专利及计算机软件著作权二十余项。目前已经在云南农业信息化研究领域形成了一定的特色，具有一定的优势。
学院现有在校本科生839名，强化“厚基础、宽口径、强应用”的人才培养模式，走专业建设与现代农业相结合的道路，在加强专业教学的同时，积极组织学生参加全国大学生电子设计大赛、数学建模比赛、科技作品比赛、创业比赛、网页设计大赛等多项活动，多渠道开拓学生的视野。学院学生近三年获省级以上奖励十余项。毕业生就业工作得到学校肯定，2007年获校级毕业生就业工作先进集体称号。
基础与信息工程学院是一个朝气蓬勃的学院，全院师生正以饱满的热情，发扬云南农业大学“开学养正、耕读至诚”的大学精神，按照“厚基博学、诚信明理”的院训，积极投身到学院的各项建设中，全面提高学院办学实力。