遵义医学院基础医学部是由数学与计算机科学、物理学、基础化学、药物化学、生物学、人体解剖学、组织胚胎学、生理学、生物化学、微生物学、免疫学、药理学、病理生理学、病理解剖学、预防医学、寄生虫学等十六个教研室及机能实验室、电镜室两个研究生组成。有6个硕士学位授予点（详见研究生部资料）。有药理学、免疫学两个省级重点学科、省重点实验室。
基础部有教职工203人，其中教授27人，副教授38人，高级实验师10人，讲师65人。具有博士学位的教师占教师比例为4%，具有硕士学位的教师占22%.教师中有8人享受国务院政府特殊津贴，有11人曾在美国、英国、德国、加拿大、瑞典、日本等国留学。目前正在攻读博士、硕士学位的教师共32名。师资队伍的学历层次和职称结构在不断提高。
基础部承担全院各专业、各层次学生的基础课和医学基础课共30余门，承担各级各类科研课题、培养硕士研究生及进修生，举办省级、国家级继续教育学习班及成人高等教育自学考试助学班。各教研室治学严谨，管理严格，有良好的学术氛围。