重庆交通大学是国务院学位委员会批准的具有博士，硕士学位授予的单位，学校研究生部是专门负责学科建设以及博士，硕士研究生招生、培养、学位、管理和就业的部门。学校有"桥梁与隧道工程" 等7个省部级重点学科；有"桥梁与隧道工程"、"道路与铁道工程"、"港口,海岸及近海工程"3个博士学位授权点；有土木工程、水利工程、交通运输工程管理科学与工程等4个一级学科硕士学位授权点；27个硕士学位授权点。具有"建筑与土木工程"等6个工程硕士专业学位培养领域、3个高校教师攻读硕士学位专业。具有授予同等学力人员硕士学位资格;
学校于1985年开始招收硕士研究生，1998年通过了交通部质量评估检查；1999年在重庆市学位办组织的全市研究生学位论文随机抽查评比中，我校得分名列全市第一名；在重庆市学位办组织的全市优秀硕士、博士学位论文评比中，每年都有论文获此殊荣。我校学位与研究生教育逐步形成规模化、多元化教育体系，已成为西部地区交通高层次专门技术人才和管理人才的主要培养基地。