软件学院的前身是数学与计算科学学院和物理与电子工程学院。数学与计算机科学学院的前身是数学专修科，设立于1960年。1972年成立数理化系，1978年分建成数学系，1998年更名为数学与计算机科学系。2003年7月，组建成计算机与信息科学学院，2006年5月更名为数学与计算机科学学院。物理与电子工程学院的前身是物理专修科，创办于1960 年。1972 年与数学、化学专业合并为数理化系，1978年从数理化系统独立出来成立物理系，1997 年5月更名为物理与电子工程系，2003 年6月组建了电子与通信工程学院，2006年5月更名为物理与电子工程学院。2011年11月，学校理工学科调整，成立软件学院。
学院现有教职工10人，其中正高职称1人，副高职称3人，中级职称5人，具有研究生学历者8 人，拥有博士学位1人，现在读博士1人。
2012年全日制在校本科生788人。设有软件工程、网络工程、信息管理与信息系统等全日制普通本科专业3个；计算机软件与理论二级学科硕士授权点1个。系统分析与集成学科2010年被自治区列入硕士授权点建设学科。
根据学校理工类学院整合方案，新成立的信息科学与工程学院、软件学院原则上执行两块牌子一套班子管理模式。
软件学院的发展目标为：“规模培养全面和谐发展的、创新型的、国际化的、市场急需的工程实用性人才的区内一流学院”；软件学院的人才培养规格概括为培养“高层次、实用性、复合型、国际化” 的软件工程专业人才。