一、 本领域重点研究方向及发展目标
（一）重点研究方向
以水产捕捞学、海洋牧场工程、设施渔业工程为重点，开展相关的基础研究和应用技术研究。
水产捕捞学主要以渔具渔法、渔具渔法对渔业资源和生态环境的影响评价、渔具革新和渔具管理研究、渔具及渔具材料的研制和标准化、捕捞渔业副渔获问题及对策研究、渔具选择性试验研究、捕捞作业结构调整研究等基础研究和应用研究为主。
海洋牧场主要以人工鱼礁研究及与之相关的基础研究和应用研究为主，开展相关的水产资源增殖系统、海洋生物培育系统、养殖水域水质净化、海洋生态环境建设和水产资源保护等工程的物理学、制作技术及工艺流程的研究。以此为基础，建立全新的海洋管理学，使礁体结构性基础研究延伸至生态学和渔业管理的范畴。建立一整套系统的人工海洋牧场理论基础，指导我国设施渔业的增养殖建设和发展。
设施渔业主要以工业化生产模式及自动控制为应用研究为主体，研究渔业生产工业化的生产模式及自动控制、设施的构造与养殖容量、个性化与通用化的养殖设施、环境质量控制、效益与效能、材料与工艺、自动化控制等。开辟设施养殖经济学，建立设施养殖的理论基础，指导我国设施养殖的可持续发展。
（二）发展目标
整合本所现有相关专业的科研技术力量和技术成果，并以过去和现有相关项目（课题）为基础，实施海洋捕捞、设施渔业、海洋牧场工程的高位战略研究和应用技术研究。建立跨学科的、相互协调和支撑的包括渔业环境、水产养殖、水产生物等学科在内的科学研究平台。成为国内具影响力的渔业工程技术研发中心。
建立设施渔业重点开放实验室，与国外研究机构或著名设施养殖企业建立互派学者研究机制。通过外部协调与连接，扩展研究领域，实施长期互惠合作的战略伙伴关系，力争使我所“渔业工程研究室”在十年内建成国际一流的学科和设施渔业综合研究室。
二、学科设置及主要研究内容
渔业工程研究室，根据研究领域和重点发展方向，拟建水产捕捞学、渔业工程、设施渔业3个学科组。
1、水产捕捞学学科组
根据水产捕捞学的定义及涵盖的专业，主要开展以下的基础研究与应用技术研究。
①基于渔业资源的特性和变动情况，研究各种适应性渔具渔法，主要包括渔具的捕捞原理、捕捞方法、适渔性和捕捞选择性以及渔具渔法的改进和优化设计；
②进行渔具渔法调查研究，评价渔具渔法对渔业资源的影响，起草和修订渔具标准；
③重点从事环境安全、资源保护型渔具渔法研究和负责任捕捞技术研究；
④远洋渔业资源探捕及渔具渔法研究；
⑤优良渔具渔法和先进渔用设备设施推广应用；
⑥渔业资源的保护、利用和管理技术措施研究。
目标：
通过开展鱼类行为与渔具渔法的关系研究，为改进和优化渔具设计提供科学依据和技术支撑。通过开展渔具设计与渔业管理的关系研究，建立适度发展捕捞渔业与合理利用渔业资源的实用化可操作模式。通过开展新型渔具材料技术研究，为渔具制作提供良好材料资源，促进捕捞渔业可持续发展。
2、设施渔业学科组
主要以集约式养殖技术及设施研发为主，开展设施渔业的关键技术研究。
① 深水抗风浪网箱的设计与制作；
② 深水抗风浪网箱配套设施的研究与开发；
③ 深水抗风浪网箱控制技术的研究；
④ 深水抗风浪网箱养殖产业化的研究；
⑤ 开展工业化设施养殖的研究。
目标：以生态学、环境学为基础，研究工业化养殖设施和关键技术，为我国设施养殖提供高效、环保、节能技术装备，全面提升我国水产养殖的技术及装备水平。
3、海洋牧场工程学科组
海洋牧场工程的研究，主要以海洋牧场化工程为研究主体。开展相关的水产资源增殖系统、海洋生物培育系统、养殖水域水质净化、海洋生态环境建设和水产资源保护等工程的物理学、制作技术及工艺流程的研究。
近期主要以人工鱼礁研究及其生物环境效应评价为切入点，展开包括人工鱼礁设计、礁体研制、礁体流体力学分析、礁区生物资源调研、人工鱼礁集鱼效果评价和效益评估、人工鱼礁与渔业资源增殖保护 、人工鱼礁与休闲渔业发展等研究，为下一步渔业工程研究主题奠定基础。
目标：为我国海洋开发、资源增养殖、环境生态保护提供典型示范。