湖南农业大学动物医学院前身是始建于湖南农学院畜牧水产系，1994年撤系建立动物科技学院。为了适应与国际接轨及国家兽医体制改革的需要，2005年12月在动物科技学院兽医系的基础上成立动物医学院。学院创立四年来，现在拥有教职工64人，其中教授16人，副教授20人（含高级实验师4人，副研究馆员1人，高级农艺师1人，高级兽医师1人），中级职称18人（含实验师2人，经济师1人），助理级职称5人（含助理实验师2人），工人4人，其中博士毕业17人，硕士毕业26人。专任教师45人，博导6人，硕导24人，校外兼职硕导5人。
学院下设兽医系、药学系、动物检验检疫系3个系,1个动物实验实践教学中心，1个湖南省兽药工程技术研究中心，1个湖南省兽药饲料监察所药物安全性评价及临床疗效实验基地，1个校级兽药研究所，1个动物疾病防治研究所和1个动物医院，1个省部共建基础实验室，1个国家级动物科学实验教学中心。学院现开设动物医学、动物药学2个全日制本科专业；拥有临床兽医博士点，兽医学一级学科、基础兽医学、临床兽医学、预防兽医学和兽医硕士专业学位5个硕士点；动物医学专业为湖南省重点建设专业，临床兽医学为省重点建设学科。
学院近三年共获得国家科技成果奖两项，省、校级科技成果奖十六项，在“双百”科技富民工程中，重点示范基地一个，一般示范基地二个；现有国家级实验教学示范中心一个，省级兽药工程技术中心一个，校级科研平台三个：湖南农业大学兽药研究所，湖南农业大学动物疾病防治研究所，湖南农业大学动物保健研究技术中心。在研课题90余项，其中国家级项目5项，省级项目40余项，校、院级项目30余项，横项向课题17项，总共科研经费500多万元。近四年，学院共有国家发明专利11项，主编和参编公开出版教材和专著30本。公开发表学术论文500余篇，其中被SCI收录论文18篇，核心期刊150余篇。