院系设置
本所按学科专业设有计算机研究室、C3I及软件研究室和计算机应用研究室。
同时按科研生产设有系统科研部、系统软件部、产品研发部、工程部及若干研发中心、经营公司等。
重点实验室
工业微电子测试校准实验室暨中国船舶工业微电子产品检测中心。1997年由船总批准建立船总微电子产品检测机构暨中国船舶工业微电子产品检测中心，并于1998年、2004年分别通过国家计量认证；2002年成立“中国船舶重工集团公司第七O九研究所工业微电子测试校准实验室”并于2004年3月通过中国实验室国家认可委（CNAL）认可（认可证书号：No.L1092）, 2007年升级为微电子测试一级站。
可授予的学位
计算机系统结构、计算机软件与理论、计算机应用技术
三个专业的工学硕士学位。
师资力量
目前共有任职导师21人，其中博士生导师5人，17人具有研究员（教授）职称，平均年龄46.2岁。
学生人数
本学年度在读硕士研究生54人，博士研究生5人。