空间信息技术应用研究所是长江科学院非营利性公益研究所之一，成立于2000年10月。该所的主要研究领域包括整个长江流域的洪旱灾害、水土灾害的监测评估分析以及生态环境的监测评估、水资源的分布评价、水土保持的动态监测等，以及利用现代高新技术，尤其是空间信息技术，对长江流域水旱灾情及生态环境进行多尺度、高精度、短周期的动态监测和技术研究，并实现快捷而广泛的信息发布。
研究所现集中了一大批专业科技人才，其中80％以上具有硕士和博士学位。并已配置和完善了当今国际一流的空间信息技术设备，获取了开展空间信息技术在长江流域信息化建设中的应用研究所必需的大量地理信息数据，可为长江流域的可持续开发利用提供宏观的科学数据和决策依据。