长江科学院（简称长科院）是国家非营利科研机构，隶属水利部长江水利委员会，始建于1951年。长科院为国家水利事业、长江流域治理、保护、开发以及水行政管理提供科技支撑，并面向国民经济建设相关行业，以水利水电科学研究为主，提供技术服务，开展科技产品研发。
长科院下设16个研究所（中心）、7个科技企业，并设有研究生部。水利部江湖治理与防洪重点实验室、水利部岩土力学与工程重点实验室、流域水资源与生态环境科学湖北省重点实验室、国家大坝安全工程技术研究中心、水利部水工程安全与病害防治工程技术研究中心、水利部山洪地质灾害防治工程技术研究中心依托长科院等单位建设。主要专业研究领域有防洪抗旱与减灾、河流泥沙与江湖治理、水资源与生态环境保护、土壤侵蚀与水土保持、工程安全与灾害防治、空间信息技术应用、流域水环境、农业水利研究、生态修复研究、国际河流研究、工程水力学、土工与渗流、岩石力学与工程、水工结构与建筑材料、基础处理、爆破与抗震、工程质量检测、机电控制设备、水工仪器与自动化，以及计算机网络与信息化技术应用等。
长科院目前有在职职工900余人，以科技人员为主体，其中享受国家政府特殊津贴专家39人，博士100多人，具有高级职称人员300余人，已经形成了一支以学科带头人为主、博士
等青年骨干为团队的科研队伍。长科院总占地面积90余万平方米，在武汉、宜昌、重庆、丹江口等地建有科研基地，其中沌口科研基地占地600余亩，建有当今世界规模最大的河工模型——长江防洪模型。
拥有工程咨询、测绘、水资源论证、水土保持方案、水土保持监测、水库大坝安全评价、地质灾害治理工程设计、地质灾害评估、工程施工总承包、工程建设监理、水土保持工程施工监理、工程质量检测岩土类、混凝土类和计算机信息系统集成等各类各级资质证书和国家二级档案馆。长科院设有博士后科研工作站，研究生部有水利工程、土木工程等2个一级学科硕士学位授予专业，并与山东大学联合成功申报博士点，同时成为河海大学博士生培养基地之一。《长江科学院院报》为全国中文核心期刊，国内外公开发行。1993年，通过国家计量认证。2000年，在国内水利水电科研单位中率先通过了ISO质量体系认证。
60年来，长科院承担了三峡、南水北调以及长江堤防等200多项大中型水利水电工程建设中的科研工作，以及长江流域干支流的河道治理、长江流域综合及专项规划、水资源综合利用、生态环境保护等领域的科研工作；主持完成了大量的国家科技攻关、国家自然科学基金以及数十项国家科技计划和省部级重大科研项目。同时，还为国民经济建设相关行业提供了大量的技术服务，提交科研成果8000余项；荣获国家和省部级科技成果奖励400余项，其中国家级奖励30余项；获得国家发明和实用新型专利50余项；主编与参编国家及行业技术标准、规程规范30余部。近5年来，出版专著45余部。
1958年，毛泽东同志在武汉接见首任院长何之泰博士。1989年，江泽民同志视察长科院。1987年，李鹏同志为长科院题写院名。2003年，长科院荣获全国五一劳动奖状。2008年以来，长科院分别荣获全国水利科技工作先进集体、全国水利抗震救灾先进集体称号、湖北省直机关文明单位等荣誉称号。
长江科学院研究所简介
| 重庆科学实验研究中心 | 宜昌前坪科研基地 | 科研基地（沌口）管理办公室 | 综合服务中心 |
| 科技成果推广及信息中心 | 生态修复技术中心 | 野外科学观测中心 | 工程质量检测中心 |
| 爆破与振动研究所 | 土工研究所 | 岩基研究所 | 材料与结构研究所 |
| 水力学所 | 国际河流研究所 | 农业水利研究所 | 工程安全与灾害防治研究所 |
| 空间信息技术应用研究所 | 流域水环境研究所 | 水土保持研究所 | 水资源综合利用研究所 |
| 河流研究所 |