湖北工业大学生物工程学院创建于1977年，下设四系一个中心（生物工程系、食品科学与工程系、制药工程系、生物技术系、实验中心）。
生物工程学院拥有轻工技术与工程、食品科学与工程两个一级硕士点，生物化工一个二级硕士点和三个工程硕士点；发酵工程是湖北省优势学科，食品科学是湖北省重点学科。设有生物工程、食品科学与工程、制药工程、生物技术、生物科学五个本科专业,其中生物工程是湖北省品牌专业。目前现有全日制在校普教本专科学生及硕士研究生一千七百余人。
发酵工程学科为湖北省首批重点学科，经国内同内专家验收、评估认为处于华中地区领先地位。学院还拥有发酵工程教育部重点实验室、工业微生物湖北省重点实验室、湖北省食品发酵工程技术研究中心、湖北省中小企业共性技术——食品及微生物研发推广中心、发酵工程湖北省工程实验室5个省部级研发平台。
生物工程学院拥有一支结构合理、水平较高的师资队伍，现有教职工81人，其中，教师50人,实验员13人。专任教师中，有教授23人，副教授23人，博士生导师7人，硕士生导师43人，38人具有博士学位；14位教师分别在美国、日本、加拿大、澳大利亚、英国、罗马尼亚、波兰等国学成归来。学院有 6人享受省政府特殊津贴，5人入选为湖北省新世纪高层次人才工程。学院设有3个楚天学者岗位，6名“楚天学者”特聘教授、2名“楚天学子”、3名“百人计划”人选。 目前分别与美国北伊俐罗伊大学、英国威尔士大学、香港大学、中科院武汉病毒所、华中科技大学、武汉大学、华中农业大学联合培养博士生。学院始终以团队建设作为学科建设龙头来抓，目前以形成了生物质能源、微生物亲水胶体、传统发酵制品现代改造、发酵工艺代谢调控、现代农业加工技术、药物制剂等稳定的研究团队。
生物工程学院拥有7000㎡的教学科研大楼，设有生物能源研究所、中英共建湖北工业大学菲利普斯亲水胶体研究中心、生物工程研究所、药物及制剂研究所，配备有进口高档分析仪器和生物反应器等设备,仪器设备总价值3500余万元。学院与广济药业、安琪酵母、枝江酒业、稻花香酒业、白云边酒业、山东潍坊盛泰药业、河南金丹数家企业共建教学科研及学生就业基地。
生物工程学院按照现有学科特点及发展需求，确定了“调整，发展，突破”的发展思路，重点围绕发酵工程、食品科学、制药工程三个领域开展研究工作。生物工程学院有较强的科研实力，近三年来，承担国家级项目12项，省部级项目65项，获得发明专利16项，三大检索收录论文90多篇，8项科研课题获省湖北科学技术进步奖。
在各级主管部门及专家的支持下，经过多年的建设和发展，生物工程学院已呈现良好的发展态势，核心竞争力不断增强。