我院独立进行研究生教育始于1995年；
2001年12月21日成立研究生部；
2002年1月18日设立研究生部党总支。委员：张骐、吴彬、宋希亮、李海平；
现有机构设置及人员分布情况：
职务或机构 | 负责人 | 工作人员 | 工作分工 |
党总支书记 | 张骐 | 队伍建设、制度建设、党团学生工作 | |
部主任MBA中心主任 | 吴彬 | 负责全面行政和业务工作 | |
部副主任 | 宋希亮 | 协助各项业务工作，侧重于统招和在职研究生培养管理 | |
办公室 | 顾月琴 | 郝向华 | 具体行使招生办公室职责 |
学科建设办公室 | 李海平 | 黄鑫 | 办公室职责、学科建设及学位管理 |
培养管理科 | 李春友 | 教学、教务的日常管理 | |
团总支书记 | 李海平(兼) | 研究生日常教育和管理 |
2003年我院又获得了工商管理硕士（MBA）授权资格；
2002年我院获得在职申请硕士学位授予权，现有在读研究生课程进修班学员270余人；
现有校内硕士生导师55人，校外兼职导师11人；
现有硕士点的布点时间、所属院系、导师及学生情况：
| 学科 | 所属院系 | 布点时间 | 导师数 | 在校生数 | ||
| 管理类 | 1 | 会计学 | 财务会计学院 | 1993.12 | 11 | 85 |
| 2 | 企业管理 | 工商管理学院 | 1997.10 | 8 | 49 | |
| 3 | 技术经济与管理 | 统计与计算科学系 | 2003.05 | 3 | 0 | |
| 4 | 管理科学与工程 | 信息管理学院 | 2003.5 | 7 | 0 | |
| 经济类 | 5 | 政治经济学 | 经济学系 | 2003.5 | 4 | 0 |
| 6 | 财政学 | 财政金融学院 | 2000.12 | 5 | 12 | |
| 7 | 金融学 | 财政金融学院 | 2000.12 | 4 | 26 | |
| 8 | 国际贸易学 | 国际贸易学院 | 1997.10 | 6 | 38 | |
| 9 | 统计学 | 统计与计算科学系 | 1995.10 | 6 | 7 | |
| 10 | 数量经济学 | 数理经济研究所 | 2000.12 | 4 | 10 | |
| 合计 | 55 | 228 | ||||
从2003年开始，与山东大学签定了研究生联合培养协议，每年选派一定数量的优秀研究生到山大进行学习。