农业水土工程硕士点设“灌溉排水理论与技术”，“农业水土资源与环境”，“农田水利工程建设与管理”3个研究方向。本硕士点有教授8名，副教授5名，有博士6名，有硕士生导师13名。
节水灌溉理论与技术研究方向是针对我国水源性缺水、水质性缺水、用水结构性缺水以及干旱性缺水的特点，研究工程节水、农艺节水以及作物高效用水的各种高新技术和实用技术。农业水土资源与环境研究方向针对我国人口多、土地资源少、水资源紧缺的基本国情，研究农业水土资源的利用与评价、农业水土环境的治理与保护的理论与现代工程技术。农田水利工程建设与管理主要是对农田灌溉与排水系统规划设计理论与方法、工程建设科学管理理论与方法、灌区及小型水利工程的管理体制和管理理论与方法进行研究。