管理科学系专门从事政府部门和企事业单位高级管理人才的培养。近三十年来，数千名毕业生已成为政府与企事业单位的领导和骨干。现设有物流管理、信息管理与信息系统、财务管理（投资学方向）等四年制本科专业，其中物流管理专业为福建省特色专业。
现有教职工50余人，其中教授5人，50%以上的专任教师具有高级职称。中青年教师全部拥有硕士或博士学位，其中不乏美国、日本和国内重点大学毕业的博士，并聘请了西安交大、天津大学等名校的博士生导师作为本系的客座教授。经过多年的积累，已逐渐形成师资力量强，年龄结构合理，学术思想活跃的教学团队。在国内外权威和核心等各类刊物上发表学术论文数百篇，科研成果数十项。2008年，系党总支荣获“福建省高校先进基层党组织”称号。
本系笃行“科学、创新、民主、进取”的发展理念，在教育、教学和行政管理等方面都进行了许多有益的探索和改革，取得了明显成效。案例分析、多媒体教学、仿真模拟、现场实训和创业实践等活动已贯穿于日常教学活动中，积极主动地与国内外著名大学和企业建立了广泛的合作关系，在联合办学、实验实训基地建设和人才培养等方面都有一定的创新和突破。相继建立了金蝶管理软件联合实验室、信息管理与信息系统实验室、物流模拟实训室、现代物流管理工程技术研究中心等实验实训基地，为提高学生的各项专业技能和创新创业能力提供了现代化的软、硬件条件。
重视培养学生的实践能力、创业能力、分析和解决问题的能力是本系的办学特色。近几年，学生在各类专业竞赛中取得了骄人的成绩：2010年获全国大学生英语竞赛一、二、三等奖；获数学建模大赛全国二等奖；2009年本系学生参与的六个项目在福建省大学生“挑战杯”创业大赛中获铜奖，还获得第二届全国大学生物流设计大赛二等奖。一些学生的科研成果或被企业购买，产生经济效益和社会效益，或形成科研论文发表于全国中文核心期刊。本系学生已连续四年在学院的品牌活动——“动感地带”杯就业大赛中摘得桂冠……毕业生以理念新、综合素质高、适应能力强，受到用人单位的普遍欢迎，就业率保持在95%以上。