1、研究生入学奖学金：录取时成绩优异的学生或985高校毕业生可获企业入学奖学金，一等奖6000元，二等奖3000元，三等奖2000元。
2、研究生奖助学金：入学第一年研究生奖助学金1000元/月/人，一年按10个月领取。
3、研究生助研、助教、助管岗位津贴：导师发放助研津贴不少于200元/月/人，研究生可申请学校助教、助管岗位，岗位津贴400元/月（助教、助管岗位每月工作时间不超过20小时，20元/时，岗位数为研究生总人数的40%左右）。
4、研究生专项奖学金：学校设有优秀学生奖学金、单项奖学金、企业专项奖学金等，学生发表学术论文、申请专利等按照学术成果等级等可获得1000-5000元/（项或篇）不等的单项科研奖学金。
5、见习工资：专业学位硕士研究生培养采用校内、校外双导师培养模式，入学第二年学生将进入生产企业跟随校外导师进行为期一年的校外实践，学生可与实习单位签订实习协议或预就业协议，企事业单位将根据情况给研究生发放实习工资（平均约1500元/月），研究生实习期间校内奖学金同时发放。
2014年厦门理工学院有5个一级学科、25个专业方向，计划招收攻读硕士学位研究生180人（实际招生人数以教育部批准下达的招生计划为准）。