公共基础学院前身是公共课程部，成立于2000年6月，时为适应学校快速发展的需要，满足医学院校大学生外语、计算机和体育教学“两翼一体”的教学要求，通过整合校内资源而成立。历经十年的建设，软件和硬件都得到了长足的发展，学院在管理水平、教学科研成果、师资队伍建设以及教学环境和硬件设施等方面都有了质的飞跃。
为了适应新形势需求，2010年12月23日，公共课程部更名为公共基础学院，课程部下设的外语教研室、计算中心、体育教研室和大学语文教研室同时更名为外语系、计算机系、体育教学部和大学语文教学部。
公共基础学院拥有一支学术水平高、实验教学经验丰富，年龄、职称和学历（学位）结构基本合理的教学与实验教师队伍。承担着全校各专业、各层次学生公共基础课程的教学，并承担全校教职工和学生各类竞技及群体性活动比赛的任务。
学院现有教职员工94人，其中，专职教师76人，兼职教师5人。教授1人，副教授17人，中级职称63人。博士学位2人，硕士学位53人。现有党员55人。学院拥有教学、科研实验室用房面积2800平方米，拥有计算机教学机房5个、教学语音室6个、自主学习中心2个，实验设备总数1000余台套，设备总值615万元。现有机房、语音室和自主学习中心向学生开放，年辅导学生上机实验人数5800多人，年实验人时数近40万。