管理科学与工程学系是我国最早设立的管理科学系之一。现有教师24人，其中教授8人（博士生导师4人）、副教授10人、讲师6人，设有“管理科学与工程”硕士点、博士点及博士后流动站和“信息管理与信息系统”、“电子商务”本科专业，其中“管理科学与工程”为浙江省重点学科。
管理科学与工程学系设有管理科学与信息系统研究所、管理工程研究所以及电子商务教育研究中心，以科技管理、技术创新与战略管理、信息系统与管理等方面出色的教学和科研著称。
系主任：吴晓波教授
系副主任：卢向南教授、李小东副教授