本学科为国务院学位办第九批批准的博士学位授予点，同时拥有微生物学和免疫学两个硕士学位授予点。作为南京医科大学校级重点学科目前正在承担国家级课题6项、省级课题16项，获科研经费140多万，1998年以来，共发表论文60余篇，其中SCI收录10篇。获部省级奖励5项，市厅级奖励2项。出版教材和专著5部。
本学科现有专职及兼职研究、技术人员15人，其中教授2人、副教授3人、中级技术职称6人；博士、硕士生导师6人。
竭诚欢迎具备细菌学、免疫学、病毒学、分子生物学等知识与技能的毕业研究生来本学系工作！欢迎有志之士报考本学系博士、硕士研究生和来学系做博士后研究！
微生物与免疫学科的研究方向：
1.病毒免疫2.分子病毒学3.免疫调节与自身免疫病4.肾脏免疫病理
学科带头人：王迎伟（博士教授博士生导师）
系主任、系副主任：卢春（博士副教授博士生导师）（主持工作）
系办公室电话：0086-25-6862901 6862910 6863176