2014年南京医科大学招收攻读硕士学位研究生规模数约为800名（其中专业学位招生约290名，此规模数仅供参考，最终以当年教育部下达指标为准，免试推荐生占招生指标）。
南京医科大学实行差额复试，复试比例为1：1.5，根据初试成绩和复试成绩各占50%得到录取成绩，依据录取成绩排名确定录取名单。
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临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学等专业研究生报考执业医师政策请参考《中华人民共和国执业医师法》和国家卫生部每年“医师资格考试报名资格规定”等相关文件。