森林资源与环境学院（原林学系）是南京林业大学的骨干学院。长期以来，学院秉承传统，与时俱进，不断改革创新，发展壮大，在人才培养、科学研究和社会服务等方面取得了显著成绩，为我国的林业建设和社会经济发展做出了突出贡献。2007年被评为全国教育系统先进集体。
学院现有林学、地理信息系统、环境科学、生物技术、生态学、生物科学、园艺、食品科学与工程8个本科专业。有生态学、植物学、林木遗传育种、森林培育学、森林保护学、森林经理学、水土保持与荒漠化防治、野生动植物保护与利用、遗传学、微生物学等14个博士点学科，17个硕士点学科。有3个国家级重点学科，1个江苏省重中之重学科，1个江苏省重点学科，4个国家林业局重点学科。有林学、生物学2个一级学科博士学位授予点和林学、生物学2个博士后流动站，以及1个江苏省高校“青蓝工程”科技创新团队和2个江苏省高校优秀科技创新团队。学院下设6个系和1个综合分析中心，17个校级实验室，4个研究所，5个研究中心和1个研究室。有1个省部共建教育部重点实验室，1个国家级实验教学示范中心，6个部省级重点实验室，3个部省级生态定位站。
学院师资力量雄厚，现有教职工138人，其中教授40人、副教授30人。有中国工程院院士1人，长江学者特聘教授1人，国家“百千万人才”3人，教育部“优秀人才”3人，江苏省“333”工程首席科学家2人，江苏省“333”工程领军人才4人，享受国务院政府特贴5人，江苏省有突出贡献的中青年专家3人，国家林业局有突出贡献中青年专家3人、跨世纪学术带头人5人，江苏省高校“青蓝工程”中青年学术带头人8人。近十年来，共培养本专科、硕士、博士等各类毕业生6000余人，现在读博士、硕士和本科生2500余人。
目前，学院正承担着国家“973”、“863”、国家自然科学基金、重点和面上项目，以及部省级等课题200多项。主持完成的成果，获国家科技进步一等奖、二等奖12项，部省级奖励42项。2000年以来，在国内外核心期刊上发表论文3000余篇，出版教材、专著和译著100多部。
学院还高度重视国际合作与交流，先后与美、日、加、英、法、德、俄和瑞典等十几个国家的高校或研究机构建立了人才培养和科技合作关系。