马克思主义学院的前身是1958年成立的政治理论教研室、1978年成立的马列主义教研室、1987 年成立的南京邮电学院社会科学部，2004年更名为社会科学系，同年开始招收公共事业管理专业本科生， 2008年9月更名为人文与社会科学学院，2011年3月与人文与社会科学学院分立，成立马克思主义学院。
马克思主义学院现设原理教研室、德法教研室、概论教研室、纲要教研室四个教研机构。另设学院办公室、图书资料室、教学档案室三个管理与教辅部门。此外，物联网产业发展研究基地挂靠我院。
马克思主义学院承担学校本科生、研究生思想政治理论课教学工作和马克思主义理论科学研究、学科建设工作。近年来，在学校党委的高度重视和领导下，学院不断加大教学改革创新和课程建设力度，构建四位一体的教学机制，切实提高思想政治理论课的教学质量和水平，充分发挥在学校思想政治教育中的主渠道作用。