河海大学学术型硕士研究生标准学制为3年，全日制专业学位研究生标准学制2年。
按照国家政策，从2014 年入学的研究生开始实行收费制度，学校将按照国家和江苏省的规定收取学费。
为完善研究生培养的激励机制，吸引优质生源，学校将建立国家助学金、国家奖学金、学业奖学金、专项奖学金、单项奖学金、“三助”奖学金、国家助学贷款等多元奖助体系。具体评定办法按河海大学相关文件执行。