上海高等研究院招收的学术型硕士生和全日制专业学位硕士研究生基本学习年限均为3年，硕博连读生的学习年限一般为5年。
上海高等研究院2014年度研究生招生将按照国家规定进行研究生教育投入机制改革，对新入学研究生收取学费，同时将完善研究生奖助政策体系，提高优秀在学研究生的奖助力度。