上海医药工业研究院2014年拟招收攻读学术型硕士学位研究生65名左右，招生人数（含统考生、免试推荐生）根据国家计划下达数等具体情况可能会有所调整。
2014年上海医药工业研究院研究生培养费由上海医药工业研究院承担。2014年起国家对于计划内研究生收取学费，要求硕士生每人每年学费不超过8000元。上海医药工业研究院对于非定向研究生收取学费3000元/学年/生，所收学费全部用于提高原有奖学金和助学金的额度。奖学金不低于80%的覆盖面，助学金100%覆盖面。