地球化学硕士学位点2003年获的批准，同年开始招生，主要培养地球化学高级专业人才。该硕士点主要有油气地球化学、环境地球化学、矿床地球化学、污染防治工程及生物地球化学5个研究方向。其中油气地球化学方向开创于20世纪80年代，在同行中享有较高的声誉，以黑龙江省特聘教授、博士生导师卢双舫教授为首的研究团队在天然气富集主控因素剖析及资源评价研究、非常规油气（未低熟油、煤成油等）成因机理及资源评价、碳酸盐岩生排烃效率及评价标准研究等方面形成特色和优势。另外博士生导师刘晓艳教授领导的研究团队在国内较早地开展了土壤石油有机污染方面的研究工作，主要从事土壤及水中石油类污染物迁移转化规律及防治、湿地系统环境污染检测与生态控制研究、清洁生产审核等方面的研究。
主要研究方向有油气地球化学研究方向和环境地球化学研究方向。其中油气地球化学研究方向2000年以来先后承担国家“973”项目1项，国家自然科学基金项目2项，国家攻关项目1项，部级攻关项目4项，中国石油天然气总公司创新基金2项，黑龙江省杰出青年基金1项，教育部优秀人才材支持计划基金项目1项，黑龙江省自然科学基金3项。先后在《中国科学》、《科学通报》、《石油学报》等核心期刊上发表论文60余篇，其中被SCI检索3篇，EI检索6篇。环境地球化学研究方向是2001年以来随着国内外环境学科的发展潮流建立起来的新的研究方向，在污水、土壤、气体环境污染防治研究，清洁生产审核，湿地系统生态环境研究以及油田污染综合治理等方面开展相关的研究工作，已承担有关科研项目十余项，在国内外科技期刊上公开发表研究论文近20篇。
本硕士点重点实验装置有美国PE公司的气-质联用仪（GC-MS），气相色谱（GC）， 原子吸收光谱仪（AA）；WATERS的液相色谱仪， 挪威的GHM烃分析仪， 法国岩石评价仪，德国有机元素分析仪，国产CO2超临界萃取仪等。