微生物学科系生物学一级学科下的二级博士点学科，现拥有2名教授，2名副教授，3名讲师。教师中57%具有博士学位，是一个年轻极有创造力的团队。
学科的科学研究以林区特色资源为基础，开展大型真菌系统学及应用研究，现保存100多种200多株大型真菌，为国内白腐菌菌种保藏最多单位。
污染物降解微生物学的研究是学科科研的另一特色，相关的生物质资源利用、造纸废液处理、染料降解、石油污染土壤的原位修复等领域的研究成果，具有较高的学术地位和价值。
生物制药领域研究本着为区域生物产业服务的理念开展，研发的双歧杆菌活菌制剂“康乐片”已产业化，益生菌饲料添加剂已开始中试，青蒿素产业化的基础研究也取得了良好进展。
近年学科的研究生教育和培养，也取得了很大的成绩，经受住了就业市场的考验。毕业生就业单位的层次普遍较高，就业单位对毕业生的反馈评价也很高。
学科带头人赵敏教授，男，1964年12月29日出生，博士，博士生导师，黑龙江省富锦县人。东北林业大学大庆生物技术研究院副院长，东北林业大学微生物学科带头人，东北林业大学北药技术研究所副所长。黑龙江省植物病理学会常务理事，黑龙江省食品药品监督管理局首届食品安全专家。
在“Applied Microbiology And Biotechnology”、“ World J Microbiol Biotechnol” 、“J.Liq. Chromatogr. & Related Tech”、“分析化学”、“色谱”、“中国生物化学与分子生物学学报”、“植物生理学通讯”、“中国造纸学报”、等国内外核心期刊上已发表论文80余篇。其中SCI收录8篇，EI收录10篇。出版专著3部。开设的本科生课程有：生物制药、药材栽培学、药材加工学、生物技术、微生物生态学、微生物学、环境微生物学、发酵工艺学、微生物工程、污染物降解微生物学（BM课程）。开设的研究生课程有：高级微生物学、现代微生物实验技术、污染物降解微生物学等。
主要研究方向：污染物降解微生物学（利用真菌漆酶降解污染物）；药用植物生理学（种内化感）。