理学院现有教职工136人，党政管理人员13人,专任教师123人,其中教授27人（含博士生导师3人），副教授21人。 专任教师中具有博士学位32人，占专任教师人数的26%；具有硕士学位61人,占专任教师人数的50%;攻读博士学位专任教师32人，攻读硕士学位专任教师17人。30-50岁教师56人，占教师总数的46%。第一学历为非本校毕业有81人，占学院专任教师的69%，最高学历为非本校毕业(包括有境外教育经历人员)有67人，占学院专任教师的66%。到2005年，理学院人才引进与培养工作取得突破性进展，获得哈尔滨工程大学“人才工作优秀单位”荣誉，目前，共引进博士20人。在专任教师中，有14人有国外或境外进修或学术研究的经历，有15人被派到国内高校进行专业课课程学习。他们除担任专业课的教学任务外，还承担全校本科生及研究生的数学、物理等基础课及其它相关课程的教学工作。
理学院设有“数学与应用数学”、“信息与计算科学”、“电子科学与技术”、“光信息科学与技术”4个本科专业，具有“应用数学”、“光学”、“光学工程”、“系统理论”4个硕士学位授权学科,同时学院还拥有“光学工程”工程硕士授予权学科。 “十五”期间，学校投入1100多万元用于学科发展和专业建设，“电子科学与技术”本科专业被评为省级重点学科；“大学物理”、“高等数学”、“数学建模”、“数学物理方法”4门课程为省精品课程。另外，“大学物理实验”、“工科数学系列”、“计算方法”3门课程为校级精品课程；“大学物理实验”为省示范实验基地。
理学院一贯秉承“教学第一、重视科研、发展梯队、合理布局”的办学指导思想，素有教学认真、治学严谨的优良传统，教学成果丰硕。获得黑龙江省优秀教学成果一等奖4项、二等奖6项。在2003年和2005年本科教学工作测评中，理学院两次取得第一名的好成绩，学校授予“理学院本科教学工作优秀单位”荣誉。在2003年和2005年，我校“十大示范主讲教师”评选中，理学院有5人7人次获得该项荣誉。在三届“优秀主讲教师”评选中，有8人10人次获得获得一等奖，有13人17人次获得二等奖。2005年，我院获得新世纪教改工程立项省级2项、校级7项，获得校级CAI课件立项4项。获得高等教育科学研究“十一五”规化课题省级1项，校级4项。获得校级实验研究立项6项。获得哈尔滨工程大学基层精神文明建设项目立项2项。校级题库建设2项。2005年，理学院获得省优秀硕士论文1篇，校优秀硕士论文1篇。
理学院十分重视优秀人才的培养，78级物理专业毕业生谢金春博士获首届吴健雄物理奖（全国3人）及1995年求是科学基金奖（全国20人）；77级数学专业毕业生林宗柱博士已经是国际上不一定影响的代数群表示论方面的专家。该院的数学建模教学组为我校培训的参赛队曾荣获美国国际数学建模竞赛1994年一等奖，及95年、96年、99年和2000年二等奖，2001年获得一等奖、二等奖各一项，2002年获全国二等奖两项，黑龙江赛区一等奖两项，2004年获全国二等奖两项，黑龙江赛区一等奖一项，二等奖两项，三等奖四项，2005年获国际二等奖四项。
理学院的主要研究方向，在数学方面有非线性偏微方程、图论及计算数学、概率统计等；在物理学方面有混沌理论、声子晶体、光子晶体、生物物理等；在光电子技术 方面有光纤传感技术、光电子学领域形成了一个以年轻学者为主体的优秀人才群体。年轻的学科带头人苑立波教授在光纤传输理论、光纤传感技术及智能结构等研究 领域取得了突出成绩，在国内外重要学要刊物上发表论文150余篇，96年被评为黑龙江省优秀中青年专家，97年获黑龙江省青年科技奖，2000年获省青年杰出科技创新创业奖，2002年获教育部第三届高校优秀青年教师奖，2003年获教育部高等学校优秀骨干教师称号。学科带头人王政平教授在光学电流传感器技术领域的研究成果达到世界先进水平，在国内外重要学术刊物上发表论文80余篇，98年被评为黑龙江省优秀中青年专家，2004年获全国模范教师。学科带头人刘亚成教授在非线性发展方程整体解的存在性、稳定性等研究方面取得丰硕成果，在数学学报、数学学刊（全国核心期刊）等刊物上发表论文40余篇。学科带头人沈继红教授已经成为数学建模方面的知名专家，其指导的学生和参赛队伍多次在数学建模竞赛中取得优异成绩，带头建设者的数学建模课程已经评为黑龙江省精品课。
近几年来，理学院在国内外重要学术刊物及国际学术会议上发表论文６00余篇,其中被"三大检索"收录100多篇,获得发明专利授权1项,实用新型专利授权14项。