本专业成立于2003年5月，食品科学与遗传工程研究院与应用化学系、生命科学系、环境工程系联合组建生物化工专业，配有优秀的师资力量和先进仪器设备，现有教授20人，副教授25人，讲师30人，主要研究领域有：食品生物工程，农产品加工工艺，乳制品加工工艺、畜产品加工工艺，动植物细胞培养工程，生物活性物质分离纯化工程，生物反应及反应器工程、，海洋生物技术，环境生物工程等。
一、培养目标
按照研究生教育要 “面向现代化、面向世界、面向未来”的要求，培养德、智、体全面发展的社会主义现代化建设所需要的人才。本专业的硕士学位获得者要求：1）掌握现代生物技术、生物反应器工程、生物分离工程、农产品及食品加工新技术、食品安全检测与控制等生化工程方面的基础理论和系统的专门知识，2）掌握本学科的现代实验技能和计算机技术，熟悉生物工程的研究现状和发展趋势，具备进行生物工程、食品工程方面的科学研究的能力和良好的科学道德。3）对外语具有较熟练的阅读、写作能力和基本的听、说能力。培养出具有教学、科研和生产管理能力的高级技术人才。
二、学科专业和研究方向
1．学科专业：生物化工
2．研究方向：
（1） 生物合成与加工工艺
以动物、植物、微生物为主要原料，将基因工程、细胞工程、酶工程等现代生物技术应用于食品工业中，研究开发高科技食品，解决生产中生物技术和工程技术问题，主要研究生物产品的理化性质、功能性质、加工工艺品质与现代加工的新技术、新理论、新材料和新设备，重点研究生物产品深度开发和高效利用技术。
（2） 生物分离工程
对细胞生长动力学、次生代谢产物及生物反应器进行研究。同时进行生物有效成分的高效分离技术与理论的研究，特别是生物活性大分子物质的分离纯化及配套技术的研究。
三、课程及论文工作时间
全日制攻读硕士学位的研究生学习年限一般为2.0年，论文时间不少于1--1.25年；学习课程时间0.75--1.0学年。