渤海大学数学系应用数学学科为省重点学科。始建于 1958 年，自 1980 年以来一直被确定为学校重点学科， 2002 年被确定为省重点学科。 2000 年经国务院学位办批准为应用数学专业硕士学位授权点。该学科通过学科建设，研究方向科特色更加鲜明，水平优势更加突出，学术队伍力量更强，目前在省内具有一定的影响，并形成一定的规模。该学科经过多年努力，目前在师资队伍建设上形成了年龄结构、学历结构、学缘结构和职称结构比较合理师资队伍，该学科现有梯队人员 16 人，其中教授 3 人，副教授 5 人，博士 2 人。该学科一直追踪应用数学学科前沿动态，形成了稳定的研究方向，主要有：生物信息学、应用概率与统计两个主要研究方向。学科带头人主要以 李春 博士、 王志福 教授为主。
该学科的特色在于： 组合数学在 生物信息学中应用。这是一门运用数学、信息科学、计算机科学和系统科学的理论与方法研究生命现象、分析和处理呈指数增长的生物学原始数据并进行加工、分析和建立计算模型的一门学科。它既属于基础研究，以探索生物学自然规律为己任；又属于应用研究，它的许多研究成果可以较快或立即产业化，成为价值很高的产品。 我们的主要研究序列比较，这是生物信息学计算的核心； DNA 序列的图形表示，图形表示是生物学数据可视化的一条重要途径，是定性地分析生物学数据的一种强有力的工具；生物序列的数值刻画，这在对海量生物学数据进行数学分析方面有着重要的作用。除此这外，对线性回归模型参数的有偏估计进行了大量的研究，主要对组合主成分估计、广义根方估计、岭估计等进行了研究。
该学科经过多年的研究取得丰硕成果。出版《 概率论与数理统计》教材及《 Characterizations of DNA Primary Sequence 》专著； 在《 Journal of Theoretical Biology 》、《 Comb. Chem. High T. Scr. 》、《 J. Chem. Inf. Model. 》、《 Physica A: Statistical Mechanics and its Applications ， Journal of Biochemistry and Molecular Biology 》、《 Journal of Mathematical Chemistry 》、《 Journal of Computational Chemistry 》、《数学实践与认识》、《高等数学通报》《 东北大学学报》《 International conference on Machine Learning and Cybernetics 》等国内外重要刊物及国际会议上发表学术论文 100 余篇。其中被 SCI 检索 20 来篇，被 EI 检索 10 多篇；主持辽宁省教育厅 “ 时空混沌系统和耦合映像格子及时空混沌的相空间图谱”、“多分量可积系统的可积性及其相关研究”、“ DNA 序列的刻画与比较研究” 等 5 项科研项目。 获辽宁省自然科学优秀学术论文二等奖 2 项，获辽宁省自然科学优秀学术论文三等奖 3 项，
该学科科学研究条件比较优越。目前拥有重点学科实验室一个，图书资料齐全，期刊 100 多种。
该学科在研究生教育上取得丰硕成果，至 2002 年以来共培养研究生 37 人，其中毕业生 4 人，在校生 33 人。研究生发表论文 20 篇左右。
该学科今后的主要目标是进一步提高科研能力，产出一些重要的标志性成果，使该学科的研究达到国内领先水平；吸引人才，加强学术队伍建设，使队伍结构更加合理。