内蒙古农业大学机电工程学院始建于1960年，已形成本科、硕士研究生、博士研究生、博士后培养教育层次。学院现有农业工程博士后科研流动站1个，农业工程一级学科博士学位授权点1个，农业机械化工程、农业电气化与自动化、农业生物环境与能源工程3个二级学科博士学位授权点；具有机械工程一级学科硕士学位授权点1个，农业机械化工程、农业电气化与自动化、农业生物环境与能源工程、机械设计及理论、机械电子工程、机械制造及其自动化、车辆工程7个硕士学位授权点。同时，农业工程学科具有工程硕士学位授予权，农业机械化工程学科是农业推广硕士学位和高等学校教师在职攻读硕士学位授予学科。
学院设有农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、工业设计、农业电气化与自动化、电气工程及其自动化、车辆工程6个本科专业。农业机械化工程、农业电气化与自动化学科是内蒙古自治区重点学科，农业机械化及其自动化专业、机械设计制造及其自动化和农业电气化与自动化3个专业为自治区品牌专业。学院下设农业机械化、电气化与自动化、机械设计与制图、机械制造、车辆工程5个教研室，1个机电工程实验中心，9个校外实习基地， 1个教学实习工厂、1个驾驶员培训中心。学院还下设农业工程成套设备、湖泊与环境工程、新能源技术、畜牧工程4个研究所。
学院现有教职工105人，其中博士生导师5人，硕士生导师23人，教授19人，副教授39人，享受政府特殊津贴2人，入选内蒙古自治区“321”人才工程第一层次1人，深入生产第一线突出贡献专业技术人员2人，入选内蒙古自治区“111”人才工程第二层次1人，内蒙古自治区有突出贡献的中青年专家1人。近年来，学院主持完成省部级以上各类科研项目80多项，其中获得国家科技进步二等奖1项，省部级科技一、二、三等奖18项，在国内外学术刊物或学术会议上发表论文1000余篇，其中被SCI和EI等国际重要检索工具收录100多篇，作为主编、副主编出版专著、教材30余部。
学院注重理论联系实际，把产、学、研结合作为学科建设、科学研究、人才培养、成果转化的主要途径。近年来学院教师完成的科研成果中有30多项成果得到转化，产品畅销内蒙古自治区和山西、河北等11个周边省区，在上述地区农牧业生产中发挥了极其重要的作用，取得了良好的经济效益、社会效益和生态效益，中央和自治区有关领导以及国内外专家多次参观学院产、学、研成果，并给予了充分肯定和高度评价。
学院截至2011年9月有在校生2181人（其中博士生19人、硕士生130人、本科生2032人）。学院毕业生一次性签约率连续三年均在80%以上，其中60%的学生在区外就业，主要分布在北京、天津、上海、河北、山西、山东、广东、浙江、江苏、陕西、湖北、江西、辽宁、吉林、黑龙江等省市。学院每年按一定比例，推荐品学兼优的本科生和硕士研究生分别免试攻读硕士学位和博士学位。培养出的学生中有我国著名大学知名教授、省部级领导干部、企业家以及各条战线的科技人员和管理人员等。