该所主要从事辐射生物效应、职业危害防治、职业健康监护、核事故医学应急、辐射流行病调查以及环境对健康影响等研究。下设放射医学、放射卫生学、放射毒理学、环境医学和职业安全评价五个研究室。
国家环境保护环境与健康重点实验室（太原）、核工业职业病登记与服务中心设在该所。设有放射医学、劳动卫生与环境卫生学两个专业的硕士学位点。
近年来，建设项目职业病危害放射防护评价、建设项目职业安全评价、药物临床前安全性评价、放射工作人员染色体检测与评价等横向技术服务迅速发展，成为该学科领域的经济支柱。