山西中医学院中药系是培养适应社会主义现代化建设需要，德、智、体全面发展的，富有创新精神，具有中药学基础理论、基本知识和技能以及相关的中医学、药学等方面的知识和能力，能在中药生产、检验、流通、使用和研究与开发领域从事中药鉴定、设计、制剂及临床合理用药等方面工作的高级专门人才。
中药系自2000年成立以来，始终把提高教学质量放在第一位，坚持以教学为中心，不断深化教学改革，采取多种形式和途径促使教学质量不断提高。2004年获理学学士授予权，2005年中药学学科被评为学院重点学科，2007年中药学专业被评为山西省品牌专业。目前已有5届毕业生，在校学生471名。
目前我系共有30多名教师，其中教授5人，副教授3人，博士5人，硕士20人；设有中药学专业和中药分析方向，并设有山西执业药师培训中心；共有6个教研室，承担14门课程的教学任务；现有实习基地10余家，基本满足了实习教学的需要，使理论教学与实践教学有机结合，培养高素质的专业人才。
中药专业学生毕业以后可以从事中药制药、药品检验、药政管理、药品营销、新药开发、中药教学和科研工作，就业前景良好。