中西医结合临床医学系的前身是中西医结合临床医学系筹备组，成立于2003年，我们秉着 “艰且益坚，持重笃行”的办学风格，坚持“求真”校训，坚持质量生命，坚持治校从严，坚持科学发展的“四个坚持”办学理念，承奉献进取之传统，创和谐务实之作风，扬奋发向上之“校风”，在广大教职工的努力配合下，团结协作，认真工作，顺利地完成了党务、行政、教学、科研等各项工作。于2006年5月，山西中医学院中西医结合临床医学系正式建立。
三年以来，在院党政领导的支持下，在全体教职工的共同努力下，中西医结合临床医学系得到了较快的发展。现设有中西医结合内科学教研室、中西医结合外科学教研室、中西医结合妇科学教研室、中西医结合儿科学教研室、中西医结合五官科学教研室等5个教研室，同时正在筹建中西医临床诊断教研室、中西医结合方法与思路教研室、中西医结合肿瘤教研室等。
中西医结合临床医学系是以中西医临床各学科为主的集教学、科研和临床医疗为一体的教学单位。现有在校本科五年制学生670名。全系上下开拓进取，严谨治学，唯善唯精，师资人员初具规模，队伍结构较合理。现有教编教师23人，其中高级职称6名，中级职称6名，初级职称11名；教师队伍数量基本能够满足教学、科研的需要。
我系近年承担省级科研项目9项；发表学术论文30余篇；省部级以上奖1项。并且注重教学法研究，改进教学方法。近三年，承担各级教改课题7项。