儿科医学系创建于1960年，占地面积约为200平方米，1979年儿科专业开始面向社会招收第一批五年制本科生，同年，儿科专业被国务院学位委员会批准为硕士学位授予学科。
儿科系下设有系办公室、实验室及4个教研室：即小儿内科学、小儿外科学、儿童保健学、儿童传染病学。共有在编人员15名，教师编制9人，教辅2人，行政管理人员4人。其中有教授4名，副教授2名，硕士研究生毕业4名，本科毕业5名，硕士研究生导师4名。