微生物学系下设有微生物学科，该学科是国家级重点学科。拥有微生物学硕士学位授权点和博士学位授权点。。现有教师18人，其中博士生导师7人，副教授5人，高级工程师2人，是一支人员精干、梯队结构合理、素质水平高的教学和科研队伍。
长期的科研工作使微生物学科形成了分子病毒学、现代真菌学和资源细菌学、功能基因组学和生物信息学以及微生物工程学四个主要研究方向，。涉及微生物细菌采油研究，杀虫微生物基因分型、遗传改良及产业化技术研究，分子病毒研究、真菌多糖抗肿瘤、抗衰老以及疏水蛋白的研究和应用开发、中药成分的超敏感度免疫学分析法以及病原菌抗药机理的研究等多个领域，并建立了基因组学、分子病毒学、现代真菌学、石油微生物、杀虫微生物、微生物酶学、微生物资源等七个研究室，承担着国家攻关项目、省部级重大项目、国家自然科学基金、天津市自然科学基金和横向联合项目多项，年立项经费约250万元。