中国科学院自然与社会交叉科学研究中心（英文名称为Intercross-Science Research Centre for Natural Science and Social Science, CAS）成立于2000年9月，是中国科学院从事战略研究、国情与公共政策研究、金融与管理科学研究和创新政策研究的非法人研究单元，挂靠在中国科学院科技政策与管理科学研究所。中心现任主任由科技政策与管理科学研究所所长穆荣平同志兼任。
自然与社会交叉科学研究中心的发展目标是：面向国家战略需求，面向前沿理论进展，大力推动多学科的深度交叉研究，精选一批意义深远的重大交叉科学前沿选题，进行大跨度、超门类的创新性研究，加强原始性科学创新、关键性理论突破与系统性成果集成，为国家的重大决策和公共政策提供咨询，为促进中国经济、社会全面、协调、可持续发展发挥重要作用。
自然科学与社会科学交叉研究中心的发展定位是：成为国际知名的自然与社会交叉科学研究基地，复合型高级科技人才培养基地，促进我国自然科学与社会科学交叉学科的形成与发展，成为国家科学思想库的核心组成部分。