面向计算科学研究的前沿方向，选择对国民经济发展有重大意义的应用项目为背景，致力于并行计算方法的基础研究以及并行软件的研究开发，解决并行计算环境下高性能科学计算的关键技术问题，为我国高性能计算机的研制和应用做出重要贡献。
主要研究方向:
1.数值计算
(1)高性能快速算法基础研究
(2)万亿次并行数值模拟算法和软件平台、性能测试、评价和分析关键技术研究
(3)百万亿次高效能计算平台高可扩展基础并行算法研究
(4)基于层次存储的并行计算模型研究
2.非数值计算
(1)生命科学高性能计算
(2)开源机群并行数据库中间件研究开发
(3)海量数据的高效率压缩和查询研究
3.高性能数学库
面向国产处理器性能优化高性能数学库研究开发