传染病预防控制所（以下简称传染病所）是中国疾病预防控制中心领导下的国家级传染病预防控制专业机构，是全国传染病预防控制业务技术指导中心。
主要职能：
为拟订有关传染病预防控制的法律、法规、标准、规范、预案及规划、策略等提供科学依据，开展防制策略和措施的研究。
为国家生物安全提供技术支持。
实施法定传染病的监测、疫情信息的收集、处理、分析、上报等。
实施重大传染病暴发流行、不明原因性紧急疫情及突发应急事件的处理。
对省级相关业务单位的传染病预防控制工作实施技术指导。
开展传染病预防和控制相关研究及技术更新，推广研究成果。
培训专业技术人员。
所 长：徐建国 副所长：边志强、卢金星、张建中、阚飙
党委书记：孟繁逊
职能部门
所办公室
人事处
财务处
科教开发处
党群工作办公室
后勤服务中心
业务部门
腹泻病室（卫生部微生物重点实验室）
负责由痢疾菌、沙门氏菌、致病性大肠杆菌、李斯特菌 、空肠弯曲菌 、小肠结肠炎耶尔森氏菌引起的各种疾病的预防与控制
呼吸道传染病（细菌性）室
负责流脑、军团病、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯氏菌、肺炎支原体、猩红热 等疾病的预防与控制
人兽共患病室
负责鼠疫、钩体病、莱姆病、布病 、炭疽、立克次体病，包括斑疹伤寒、恙虫病、Q热、埃立克体
链球菌 、鼻疽和类鼻疽等疾病的预防与控制
消毒室（卫生部消毒检验中心）
从事消毒、耐药性监测、医院内感染等工作
结核病室
从事结核病原菌研究、耐药性监测、控制措施研究、菌苗研制等工作。
国家碘缺乏病参比实验室
疾病监测和疫情分析室
媒介生物室
从事医学昆虫、防鼠、灭鼠等工作
传染病诊断实验室
图书编辑室
包括图书情报的收集、整理、使用和专业刊物的编辑、出版、发行。