中国工程物理研究院2013年【招生简章 专业目录 参考书目】计划在25个学科专业招收硕士研究生80人。中国教育在线研究生招生报名查询系统显示，中国工程物理研究院研究生学制一般为三年，其中，基础课程学习1--1.5年，科研论文阶段 1.5--2年。
中国工程物理研究院研究生基础课程学习按专业需求分别在北京、合肥、长沙进行。
中国工程物理研究院招录的硕士研究生在学习期间待遇为，硕士生课程学习阶段：普通奖学金（含各种生活补贴）不低于10000元/每学年；根据考评结果，还可获得一次性最高2000元的优秀奖学金。硕士生科研论文阶段：普通奖学金（含各种生活补贴）不低于14000元/每学年。据中国教育在线了解，凡被中国工程物理研究院录取的硕士生不需缴纳培养费，且学习期间免收住宿费。
中国教育在线研究生招生报名查询系统显示，中国工程物理研究院从1984年开始研究生招生，目前已有10多个研究生培养单位（院属研究所、中心），5个国防科技重点实验室，4个博士后流动站。中国工程物理研究院研究生部负责统一组织和管理院属各研究生培养单位的招生、培养和学位授予工作，并负责研究生基础课程的集中教学管理。