我国经济的迅猛发展，对资源、环境及生态产生的压力越来越大，国家安全的内涵正发生着实质性的演化与拓展，其中生态安全、健康安全已成为公众关注的焦点之一。环境生物技术室主要利用生物和化学平台，研究环境污染物对生物体生存与健康的影响，同时探索利用生物和化学手段减小或修复环境污染物对生物体及其生存环境的危害。主要研究方向包括：1）环境污染物的生物毒性，特别是复合毒性及机理的研究；2）基于生物毒性测试技术的污染物生态风险评价研究；3）环境微生物技术；4）农药残留的检测技术及毒理研究；5）环境友好产品的研究与开发；6）环境生物医用分离材料和生物质资源化新工艺等。
在知识创新工程的推动下，经全室人员的共同努力，研究室在科研与开发方面均取得许多成果，已在国内外核心期刊发表学术论文300多篇，申请专利100多项，培养硕士、博士几十名，为研究室的进一步发展奠定了良好基础。