国家天文台总部前身——北京天文台成立于1958年，是国务院学位委员会批准的首批学位授予单位之一，是天文学科博士后流动站设站单位。2001年4月，中国科学院成立国家天文台，北京天文台融入国家天文台，成为国家天文台总部。国家天文台由总部及云南天文台、南京天文光学技术研究所、乌鲁木齐天文站和长春人造卫星观测站等单位组成。
2014年中科院国家天文台面向全国招收攻读硕士研究生32名左右，具体招生以教育部下达的招生名额为准。