北京交通大学深圳研究院于2002年正式进驻深圳虚拟大学园，是经深圳市人民政府批准成立的事业单位，集科研、成果转化和人才培养为一体，是北京交通大学在深圳的正式代表机构。
研究院的宗旨是：充分利用我校的特色和优势，在培养高层次研究及管理人才，承接高科技项目，推进高新技术成果转化等方面发挥作用，为特区及周边地区的经济发展作出贡献。
研究院主要从事以下几方面的工作：
1.学位学历及非学历教育与培训
2.高新技术产品的开发和成果转化
3.创办和经营高新技术产业
4.各类信息咨询和服务
作为北京交通大学的派出机构，研究院将努力发挥名校优势，为深圳及其周边地区有计划、有系统地培养各类高素质应用型人才；同时作为北京交通大学成果转化的窗口，积极创造学校与企业交流与合作的机会；研究院也将充分利用深圳虚拟大学园提供的平台，依靠当地政府、企业及社会各界力量，特别是广大校友的支持，不断扩大北京交通大学在深圳及周边地区的影响与知名度，为特区的经济发展做出应有的贡献。