2014年研究生招生，南京工业大学计划招收硕士研究生1600名左右，其中学术型硕士研究生900名左右，专业学位硕士研究生700名左右，南京工业大学2014年全日制硕士研究生招生类别有推荐免试生 、全国统考生（包括学术型和专业学位硕士研究生）、全国联考生、单独考试生。
此外，南京工业大学设立多种奖学金，如“时钧奖学金”、“巴斯夫奖学金”等用于奖励优秀研究生。我校研究生可兼任“三助”（助教、助研、助管）工作，并可获得相应的酬金。