| 001 | 数学科学学院 |
| 004 | 物理学院 |
| 010 | 化学与分子工程学院 |
| 011 | 生命科学学院 |
| 012 | 地球与空间科学学院 |
| 016 | 心理学系 |
| 017 | 软件与微电子学院 |
| 018 | 新闻与传播学院 |
| 020 | 中国语言文学系 |
| 021 | 历史学系 |
| 022 | 考古文博院 |
| 023 | 哲学系 |
| 024 | 国际关系学院 |
| 025 | 经济学院 |
| 028 | 光华管理学院 |
| 029 | 法学院 |
| 030 | 信息管理系 |
| 031 | 社会学系（含社会学人类学研究所） |
| 032 | 政府管理学院 |
| 039 | 外国语学院 |
| 040 | 马克思主义学院 |
| 041 | 体育教研部 |
| 043 | 艺术学院 |
| 044 | 对外汉语教育学院 |
| 047 | 深圳研究生院 |
| 048 | 信息科学技术学院 |
| 062 | 国家发展研究院 |
| 067 | 教育学院 |
| 068 | 人口研究所 |
| 084 | 前沿交叉学科研究院 |
| 086 | 工学院 |
| 126 | 城市与环境学院 |
| 127 | 环境科学与工程学院 |
| 182 | 分子医学研究所 |
| 192 | 歌剧研究院 |
| 891 | 基础医学院 |
| 892 | 药学院 |
| 893 | 公共卫生学院 |
| 894 | 护理学院 |
| 895 | 医学人文研究院 |
| 910 | 第一临床医学院 |
| 920 | 第二临床医学院 |
| 930 | 第三临床医学院 |
| 931 | 第四临床医学院 |
| 940 | 口腔医学院 |
| 950 | 精神卫生研究所 |
| 960 | 临床肿瘤学院 |
| 971 | 第五临床医学院 |
| 972 | 中日友好临床医学院 |
| 973 | 第九临床医学院 |
| 974 | 航天临床医学院 |
| 975 | 首都儿科研究所 |
| 976 | 民航临床医学院 |
| 977 | 深圳·北京大学/香港科技大学医学中心 |
| 978 | 首钢医院 |
| 979 | 地坛医院 |
| 980 | 解放军第302医院 |
| 981 | 解放军第306医院 |
| 982 | 回龙观医院 |
注：点击院系前代码即可查看该院系具体专业目录信息